Durch den Aufbau der neuen Unternehmensbereiche sowie ausgedehnter Entwicklungsarbeit lag der Jahresfehlbetrag im Geschäftsjahr 1999 bei 18,5 Mio. DM. Das Unternehmen konnte damit nach eigenen Angaben die Erwartungen der Analysten (minus 24 bis 28 Mio. DM) deutlich übertreffen.
Für das Geschäftsjahr 2000 erwarten Evotec eine weitere signifikante Steigerung des Umsatzes. Im Februar 2000 waren bereits etwa 50 Prozent des geplanten Umsatzes als Auftrag verbucht. Der Dienstleistungsbereich soll dabei entscheidend zum Gesamtumsatz beitragen. Mit dem Aufbau einer operativen Basis in den USA sollen zudem weitere Marktpotentiale zu erschlossen werden. Weitere Kooperationen und Verträge mit Pharma- und Biotech-Unternehmen werden für 2000 erwartet.